Madrid 1658. Le Grand Inquisiteur Diego de Arce y Reinoso est retrouvé assassiné avec un exemplaire de Don Quichotte entre les mains. Les meurtriers cherchent à mettre la main sur le Spéculum Cordis, un livre qui renferme le secret le mieux gardé de l'Église catholique. Un siècle auparavant, ce livre a été placé en lieu sûr, à Rome, par le jeune Miguel de Cervantès, futur auteur de Don Quichotte. Le père Alonso, chargé dans le plus grand secret de résoudre le crime, se lance alors dans une enquête au cours de laquelle il va risquer sa vie et ses convictions. Derrière ces mystères, des intérêts rivaux opposent le fils naturel du roi, Don Juan José d'Autriche, grand prieur de l'ordre de Saint-Jean, sa mère Inès de Calderon, enfermée dans un couvent, une novice récemment stigmatisée, et le roi lui-même. Une série de crimes poussent le père Alonso à chercher des réponses dans les signaux occultes qui parsèment l'oeuvre du célèbre auteur de Don Quichotte.